No se si existe una herramienta para hacer esto dentro del SQL Server Managment Studio. Pero si no la hay, entonces este programita le va a venir bien a más de uno. Se trata simplemente de un programa al cual se le pasa un servidor, se seleccionan las bases de datos a ser tratadas y un query que se va a correr en todas las bases de datos seleccionadas.

Es muy útil a la hora de hacer actualizaciones en muchas bases de datos similares. Yo por ejemplo trabajo con decenas de bases de datos de igual estructura y muchas veces necesito hacer un cambio, un ALTER TABLE en cada una de esas bases de datos. Bueno, con esta herramienta que hice mientras tomaba un cafecito, me ahorro mucho tiempo y dolores de cabeza, espero que les sirva. OJO que sólo funciona la autenticación por Windows. Si alguno le agrega el código para autenticar por usuario y password, sería un buen aporte.

Los mensajes están en inglés porque trabajo con gente que, pobre ellos, no hablan español...

Lo pueden descargar desde aqui.